Mi temps thérapeutique salaires et primes

bonjour,
je suis en mi temps thérapeutique, depuis octobre je perçois un demi salaire par mon employeur et le reste par la msa, mais lorsque je bénéficie d'une prime fin d'année ou de vacances mes indemnités journalières sont réduites, ce qui fait que ma prime je ne la perçoit pas pour être plus précis je cite mon exemple en chiffres
mon salaire a temps plein 1200€
mon salaire en mi temps 800€
versement de la msa 400€ egal 1200€ ce qui est correct
exemple avec prime
mon salaire en mi temps 800€
prime de vacances 400€
versement msa 0€
où est donc passée ma prime je suis lésé car mon employeur déclare toujour le même salaire de base ne devrais t'il pas intégré ma prime dans le salaire que j'aurais du percevoir lorsquil y a des primes Cette situation m'a mis dans une situation financière délicate.
je vous remercie pour les éventuels renseignement que vous pourrais m'apporter