Problème avec le remboursement d'un pret

Nous avons déposé un chèque de 8953,16 euros sur un compte banquaire le 5 aout 2008 afin de rembourser un prêt à la consomation.
Sachant que le plan d'amortissement stipulait qu'il nous restait la somme de 8910.99 euros à verser à la date du 13 aout 2008 à cette dite banque.
En faisant le calcul, la banque nous était redevable d'environ 40 euros, différence entre le montant du chèque et la somme restant due et sachant qu'il restait 2.88 euros sur le compte chèques. Le prêt a été remboursé plus d'un mois après le dépôt de ce chèque, pourtant il a bien été précisé que cette somme était déstinée au remboursement de ce prêt. Déduction, à ce jour la banque nous demande la somme de 39 Euros pour combler le découvert et clôturer le compte.
- la banque a-t-elle le droit de mettre plus d'un mois pour rembourser ce prêt sachant que l'argent est disponible sur le compte?
- Pourquoi la banque nous réclame la somme de 39 euros,alors qu'il y avait 45 euros de plus que la somme restant due?